Di sisi lain, PTS juga mempunyai tantangan baik secara internal maupun eksternal. Secara internal adalah adanya aturan, mekanisme dan kebijakan baru pemerintah dalam hal ini Kemendikbudristek yang harus dipedomani serta direspons dengan melakukan berbagai perubahan yang kadang memerlukan investasi sumber daya. Sedangkan tantangan eksternal diantaranya adalah revolusi industri 4.0 dan society 5.0 yang mengharuskan PTS untuk beradaptasi dengan melakukan berbagai penyesuaian di berbagai segi diantaranya sistem, infrastruktur, kurikulum, proses bisnis yang juga menghendaki investasi sumberdaya jika tidak ingin tertinggal dengan PTS lainnya.

Alternatif solusi yang bisa dipilih oleh PTS supaya bisa baik dan sehat dan selanjutnya bisa berkontribusi optimal bagi pengembangan sumber daya manusia di Indonesia. Pertama, sumber keuangan PTS perlu meningkatkan pendapatan di luar SPP diantaranya dengan meningkatkan kerja sama penelitian dengan berbagai institusi baik pemerintah maupun swasta, komersialisasi paten yang dihasilkan oleh dosen.

Yang mana hal ini tentu memerlukan sumber daya dosen yang berkinerja tinggi untuk menghasilkan semuanya itu. Disamping juga diharapkan peran dari stakeholders diantaranya alumni, BUMN, dan kalangan industri, termasuk pemerintah daerah. Walaupun terikat dengan aturan bahwa pengelolaan PT bukan domainnya pemda, tetapi mungkin bisa dicari celah yang tidak melanggar tetapi PTS tetap mendapatkan perhatian. Ataupun masyarakat umum yang terpanggil untuk memberikan kontribusi dalam menunjang keberadaan PTS untuk dapat berperan optimal.

Dari segi pengelolaan alternatif solusi yang bisa digunakan adalah belajar dari best practice PTS yang sudah baik jalannya, baik di dalam negeri maupun di luar negeri, para pengelola bisa belajar bagaimana mekanisme pengambilan keputusan yang tepat sehingga bisa menjawab tantangan, baik tantangan internal maupun tantangan eksternal.

Yang ketiga untuk mengatasi masalah sarana prasarana atau infrastruktur maka PTS berkolaborasi dengan PTN ataupun sesama PTS ataupun dengan lembaga penelitian atau pemerintah dalam penggunaan labor dan peralatan penunjang dalam bentuk sharing recources terutama untuk peralatan umumnya untuk bidang kesehatan dan keteknikan yang mahal harganya.

Beranjak dari fenomena di atas terlihat peran penting PTS dalam menghasilkan generasi terdidik Indonesia, sehingganya semua kita perlu memberikan perhatian pada PTS terutama yang mendapat amanah sebagai badan penyelenggaran PTS. Pemerintah daerah yang juga secara tidak langsung mendapat manfaat dengan keberadaan PTS yang berkualitas dalam menyiapkan generasi yang kompeten dan peningkatan kualitas SDM terutama di daerah mana PTS itu berada. Masyarakat diharapkan selalu juga memberikan perhatian dan pengawasan terhadap PTS untuk selalu berada dalam koridor tata kelola yang baik.